Los pastos marinos albergan gran cantidad de organismos, convirtiéndose en importantes zonas de desove, cría y alimentación para peces e invertebrados. En este estudio se caracterizó la macrofauna asociada a una pradera de la Ensenada de Yapascua, Parque Nacional San Esteban. Para ello se establecieron cuatro zonas donde se trazaron dos transectas perpendiculares a la costa, con cinco puntos de muestreo a 1m, 10m y al final de la pradera. Las muestras se tomaron desde la boca hasta la parte interna de la Ensenada durante el periodo de lluvia (julio-noviembre 2015). Se observó una marcada zonación de Thalassia testudinum y Halophila stipulacea. La biomasa en pie de T. testudinum fue mayor en julio, especialmente cerca de la boca (Z1 y Z2), y la de H. stipulacea en noviembre. Se encontró una clara separación de las zonas 1 y 2 con el dominio de T. testudinum, de las zonas 3 y 4 con mayor biomasa de H. stipulacea. La densidad total de organismos bentónicos fue de 13.800ind/m2, siendo los más representativos: poliquetos (30%), nemátodos (19%), gasterópodos (18%) y peracáridos (14%). En julio se estimó una mayor densidad de organismos (17.340ind/m2) respecto a noviembre (11.680ind/m2), presentando la boca de la Ensenada más de 70% de disimilitud respecto a la zona 4 (interna). Estas variaciones podrían atribuirse a una mayor biomasa en pie y densidad de T. testudinum en la boca, que representa una mayor disponibilidad de recursos y complejidad física para el bentos, que la especie invasora H. stipulacea.