Perna viridis es una especie exótica originaria de la región Indo-pacífica e introducida en el año 1993 en las costas venezolanas proveniente de Trinidad. La presente investigación tuvo como objetivo diferenciar morfológica y genéticamente organismos de esta especie invasora, de cinco zonas de la costa nororiental de Venezuela. Las tendencias de variación morfológicas entre poblaciones se analizaron a través de un ACP, las diferencias entre las poblaciones con un MANOVA y un análisis de similaridad entre las zonas utilizando los programas PAST 1.29 y PRIMER E.5, respectivamente. Se estimaron los niveles de diferenciación y distancia genética (D) entre localidades analizando electroforéticamente ochos sistemas enzimáticos. Los resultados evidenciaron una similitud entre P. viridis de las diferentes localidades del 96,75%; sin embargo, el ACP demostró que las poblaciones presentaron diferencias significativas entre ellas, lo que refleja la plasticidad fenotípica de la especie. Un total de 13 loci fueron revelados, dos de ellos polimórficos. Un porcentaje de polimorfismo de 0,153, considerado bajo y dentro de los rangos de otros reportes para esta especie en Malasia. El valor D demostró una baja diferenciación entre las poblaciones. Los resultados señalan que las poblaciones, genéticamente, son escasamente diferenciables y posiblemente no han tenido suficiente tiempo de asentamiento en estas localidades que permitan una mayor acumulación de diferencias entre ellas. La expansión y adaptación de especies invasoras como P. viridis, pudieran ser atribuidas a factores como la plasticidad fenotípica, la variabilidad genética y la variación epigenética.